L’Ecole s’appelait à sa création (Atelier Intercommunal de Musique des Cantons de VERCEL et PIERREFONTAINE .Elle  a vu le jour en 1988 et elle était déjà intercommunale grâce à une charte qui liait les deux cantons .C’est d’ailleurs la première école de musique à avoir fonctionné de cette façon .Dès la 1ère année, elle réunissait une centaine d’élèves, preuve d’un réel besoin de la population. Plus de cent concerts et auditions ont été donnés en milieu rural depuis sa création. Ces manifestations alliant de jeunes instrumentistes à des artistes confirmés ont vu une participation grandissante du public. Après l’assemblée générale d’Octobre 2005, l’atelier intercommunal de musique prend le nom d’Ecole de Musique Intercommunale des Portes du Haut-Doubs

Son rôle est d’apporter un enseignement de qualité au plus proche des habitants, une animation en milieu rural et d’offrir aux sociétés locales la possibilité d’entretenir leurs effectifs, quelques élèves poursuivront une carrière musicale comme musicien d’orchestre, enseignant, luthier, réparateur d’instruments, accordeur de piano ou ingénieur du son, etc… L’école compte à ce jour 180 élèves encadrés par 11 professeurs.